【基因检测】肿瘤基因检测常见问题五问五答![]() 患者是一个非小细胞肺鳞癌患者,多次化疗,身体已经不能耐受,按照医院的说法是准备一轮接一轮的化疗换,看哪个管用。患者家属希望看能找到靶向药物不,患者曾经盲试过易瑞沙,但是效果不好。 答 : 非小细胞肺鳞癌的患者在EGFR基因突变频率比较低,虽然研究表明非小细胞肺鳞癌患者EGFR基因突变,使用相应的TKI药物也是有效的,但EGFR基因突变在鳞癌的频率没有腺癌的高,腺癌的患者可以盲试,有35%以上的概率有效,鳞癌患者不建议盲试。 非小细胞肺鳞癌患者的基因突变比较多的是FGFR1扩增,DDR2突变和PIK3CA突变,晚期患者也见过其他基因突变如CDKN2A等,这些基因突变都是有相应的靶向药物的,因此不建议模仿肺腺癌的治疗措施,而是选择基因检测的方式找到什么突变,再使用相应的靶向药物。 给患者家属解释了不同产品的优劣势,十几个基因,几十个基因和几百个基因的差异。最后患者家属选择使用几百个基因的去检测,原因是晚期患者的基因突变比较多,要不只是检测到药物的敏感性突变,还得看看直接或间接影响药物疗效的基因、耐药基因突变情况,这样才能更好地指导选择药物。当然在我们癌度的爱心补贴下,几百个基因的检测相比几十个基因检测价格差异不是特别大,而且几百个基因的筛查范围更大,能够更有把握找到相应的基因突变。 使用组织样本,还是血液样本,不得不说这是个两难的问题,从基因检测公司和个人来说,都会优先推荐使用组织样本,因为癌细胞就在那里,不会存在测不到的情况,给到患者一份检测报告,基因检测公司也就是完成了义务,但是事情并没有结束。 我记得很清楚的一个例子,那个患者使用新长的病灶测到了基因突变,药物很有效,大部分病灶都被控制了,就是肝部病灶疯长,这就是肿瘤的异质性。因为不是每一个病灶的基因突变都是一样的,组织样本存在取样偏差,这是不可避免的情况。我曾设想如果患者使用外周血,会不会把肝部那个病灶的原因给找到呢。过去的事情不能重复,只是我在推荐使用什么样本时有了更多的考虑,尽量把两种样本的优缺点告知患者和家属,由他们权衡决定。 祝福这个群体,在狡猾的癌魔面前,有了基因检测,可以努力争取更好的可能。 2 问: 患者诊断为非小细胞肺腺癌,检测到KRAS有突变,下一步的靶向药物该如何选择。 答: KRAS基因突变占非小细胞肺癌(NSCLC)总数的20-30%,肺腺癌较高,肺鳞癌中不常见,KRAS基因突变主要发生在外显子2、3、4上,KRAS基因突变会导致对上游EGFR靶点耐药,即肿瘤细胞增殖信号出现了短路行为。KRAS基因在结直肠癌中突变频率也很高,一般肠癌中使用爱必妥时需要检测KRAS基因的突变情况。 KRAS处于EGFR下游,如果KRAS基因突变,其对结合在EGFR胞外区发挥药效的西妥昔单抗和帕尼单抗会产生抗性。如KRAS密码子12、13发生突变的结直肠癌患者对于西妥昔单抗和帕尼单抗无应答,总体生存率明显低于野生型KRAS患者。 KRAS基因外显子2、3 变异对EGFR TKI 类药物敏感性降低,即吉非替尼、厄洛替尼的效果受限。 目前并没有治疗KRAS基因突变的晚期非小细胞肺癌药物,各大公司的研究重点也都集中在KRAS的下游通路上,如MEK。MEK1/2的靶点药物有曲美替尼,司美替尼,MEK162。另外则是安卓健,是台湾的一种提取物,效果不是很确定,有报道说效果较好。 3 问: 患者EGFR蛋白高表达,即免疫组化阳性(3个加号),但是未做基因检测,可否使用易瑞沙或特罗凯。免疫组化显示EGFR阳性是否是使用TKI的有效预测指标? 答:EGFR蛋白高表达是指蛋白还是那个蛋白,结构没有改变,只是数目变多了,这个需要使用爱必妥等抗体药物封住多余EGFR胞外受体。 EGFR基因扩增,一般就意味着EGFR蛋白会有表达高的情况出现,因为DNA的模板多了,基本上蛋白表达就会高。 EGFR突变是指EGFR的某些DNA区域发生了突变,如19外显子缺失,21外显子的置换突变,导致EGFR酪氨酸酶结构域改变,酶活性增强,而易瑞沙等正好与突变的酶活性结构域结合较好,与正常的EGFR蛋白酶结构域结合较弱,起到了靶向治疗的作用。 EGFR的蛋白高表达和EGFR的基因突变是两类不同的突变类型,选择的靶向药物也是不同的。一般大的医院不会推荐免疫组化EGFR阳性的患者使用易瑞沙的。而且研究发现EGFR在DNA水平的扩增其实是TKI耐药的原因。 注:EGFR的过表达在许多肿瘤类型中都可以观察到,用免疫组化(IHC)法检测可以发现超过60%的肺癌患者均存在EGFR过表达,其与较差的预后有关。然而IHC检测EGFR的表达的结果并不能预测TKI的疗效。 BR.21研究中,IHC阳性与IHC阴性患者厄洛替尼的有效率分别为11.3%与3.8%(P=0.10),无统计学意义(参考文献2);ISEL研究中,IHC阳性与IHC阴性吉非替尼的有效率分别为8.2%与1.5%,亦未体现出明显差异;同样的结果在SATURN研究和IPASS研究中也得到了验证(参考文献3,4)。 有不少患者和家属咨询抽血做基因检测的准确度,是否靠谱等。由于很多患者晚期多处转移,病灶不是很好取,再就是穿刺去组织样本具有一定的创伤性,会引起气胸等并发症。所以抽一管静脉血做基因检测,这不管是从体验上,还是其他方面都引起了患者和家属兴趣。 但是故事刚刚开了个头,随着很多患者交上了那么一大叠钞票,翘首期盼地盼了十几天,得了一个全阴性的报告,也就是推荐的靶向药物是零。那熊熊燃烧的热火顿时被浇了个透心凉。于是一片怀疑声音开始出现,外周血做基因检测是否准确,灵敏度如何?是否靠谱? 首先解释外周血做肿瘤基因检测的原理 原理就是癌细胞在人体内不断地分裂,但是又受到药物、免疫系统的攻击,以及癌细胞之间的竞争等因素,很多癌细胞裂解了,其内容物DNA片段释放到血液里,这个叫循环肿瘤DNA(也叫ctDNA),当然正常的人体细胞也会裂解释放DNA,所以外周血里的DNA碎片一部分是肿瘤细胞裂解的,一部分是正常细胞裂解的,其中肿瘤细胞裂解的DNA占的比例在1%,这个比例是很低的,所以抽外周血做基因检测,如果测序深度在300乘,就不要做了,根本没有什么意义,至少的测序深度要在1000乘。 至于准确率问题,因为采集的一管静脉血,测的是血浆里面的游离DNA(测序深度至少在1000乘),同时会对离心得到的白细胞进行同样的测序(一般测序深度为300乘),白细胞的测序数据会把血浆里正常细胞裂解的DNA片段信息给过滤掉,只去分析肿瘤细胞裂解和释放的DNA片段。所以一般大的基因测序公司抽血给出的基因突变都是靠谱的,确实是来源于肿瘤细胞的。但问题是很多时候,不是每一次都能检测到肿瘤细胞裂解释放的DNA,主要是浓度太低了。 我们继续把故事说下去,外周血里的游离DNA并不是一直存在的,它们会被血液里的DNA酶给降解掉,研究认为4小时就有一半的DNA被降解了。所以血液里的DNA碎片是不断地被生产出来,又不断地被降解。是一个动态的循环过程。这样给出了一个抽血做基因检测的前提调节,患者的肿瘤病灶如果没有进展,比如刚做完手术,病情稳定期,那么血液里是没有肿瘤细胞裂解释放的DNA的,抽血检测也是检测不到的。 4 问: 患者在打化疗时,为何影响了抽血做基因检测? 答: 化疗药物通过抑制DNA合成、复制等机制来杀灭癌细胞的,当然也杀灭正常细胞。当用过很多化疗时,人体内那些活跃代谢的癌细胞都被杀光了,留存的是那些处于休眠期的癌细胞,此时抽血做基因检测,当然也是检测不到好的结果的。 5 问: 患者在使用靶向药物时,是否会影响抽血做基因检测? 答: 原则上是有影响,但不如化疗那么关键,而且靶向药物治疗时,血液里肿瘤的DNA,一部分是自己裂解释放的,另一部分是靶向药物攻击杀灭的癌细胞裂解释放的,所以这两部分癌细胞的DNA检测出来都是有意义的。而且患者也不可能完全空窗期,一个月什么治疗也不使用,就等着基因检测,这也是不现实的。 鉴于以上的原因,抽血做基因检测确实是不容易,不过如果注意了以上的一些问题,对于肺癌、乳腺癌、肠癌等患者,抽血做基因检测的准确率还是很高的。 资料来源癌度 康复乐园小编整理发布 (责任编辑:康复乐园) |







